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VisuTrack動物行為分析係統

簡要描述:

VisuTrack動物行為分析係統用於自動跟蹤和分析動物的運動、活動和行為,並提供變量,如運動速度、距離、區域活動情況等。VisuTrack不僅采用動物軀體部位劃分技術,嚴格區分動物的身體輪廓中心、動物的鼻尖以及尾根,而且*應用AI圖像識別跟蹤技術,通過學習和模擬海量的動物行為實驗原始視頻,真正實現了全程動物一鍵智能跟蹤。

更新時間:2021-03-09

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VisuTrack動物行為分析係統

 

 

VisuTrack動物行為分析係統

                               -----新一代行為識別技術

 

介紹資料

 

 

一、係統介紹

VisuTrack動物行為分析係統用於自動跟蹤和分析動物的運動、活動和行為,並提供變量,如運動速度、距離、區域活動情況等。VisuTrack不僅采用動物軀體部位劃分技術,嚴格區分動物的身體輪廓中心、動物的鼻尖以及尾根,而且*應用AI圖像識別跟蹤技術,通過學習和模擬海量的動物行為實驗原始視頻,真正實現了全程動物一鍵智能跟蹤。

VisuTrack不僅僅是一款跟蹤軟件,更是一個平台,可用於完全自動化實驗研究,提高效率並減少人為錯誤。VisuTrack作為平台,它不僅可以創建用於控製外部設備的複雜方案,如熒光燈、揚聲器、足部電擊以及食物顆粒分配器,而且可以與第三方電生理、光遺傳、鈣離子信號等實現數據同步,為科研工作者提供了理想的專屬定製化實驗平台。

二、係統模塊組成

VisuTrack包含多種主要功能模塊:

  • 基礎模塊(Basic module)
  • 輸出輸出控製模塊(I/O Module)
  • 插件模塊(Plug-in module)
  • GLP模塊(GLP module)
  • 複雜精細行為模塊

VisuTrack是一個完全利用第三代行為學技術—行為識別技術的係統。可以適應目前大多數主流行為學實驗的需要,同時提供參數,提高檢測的靈敏度和準確度。

三、軟件應用範圍

  • 學習記憶實驗

    Morris水迷宮、八臂迷宮、十二臂迷宮、Y迷宮、T迷宮、Barnes迷宮、六臂水迷宮

  • 焦慮抑鬱實驗

    高架十字迷宮、曠場實驗、自發活動、O迷宮、明暗箱(黑白箱)、強迫遊泳、懸尾

  • 探索行為實驗

新奇物體識別實驗、動物交際實驗、洞板實驗、孔洞實驗

  • 藥物成癮實驗

條件位置偏愛(CPP)、條件位置厭惡(CPA)

  • 外部控製實驗

條件性光刺激、聲刺激、電刺激、光遺傳、電生理同步,提供TTL接口後,更適用於避暗實驗、跳台實驗、睡眠剝奪實驗、學習無助實驗、飲水電擊實驗、場景恐懼實驗等

 

四、技術特點

4.1 新一代行為識別算法

係統擁有多種功能強大的動物檢測及消除噪音的檢測方法,可以應付幾乎所有的複雜實驗環境下的行為實驗,支持Animal Size動物的大小、Animal Color 動物顏色與背景差(黑-白、白-黑、雜色-變化背景等),同時支持自動閾值、手動閾值、複雜閾值(既白又黑)、頭部朝向閾值等:

  • AI智能識別法,適用於新手實驗員,能夠快速、準確、自動識別實驗動物
  • 灰度法,適合光線穩定,實驗環境背景與被檢測動物色差明顯的實驗
  • 靜態背景法,適合實驗環境背景不均衡,亮暗不明,但背景相對固定的實驗
  • 動態背景法,適合實驗環境背景不均衡,亮暗不明,且背景會微弱變化的實驗
  • 高斯背景法,適合環境背景複雜,光線微弱,動物顏色與背景差異較小的實驗

4.2 多體位點識別技術

軟件對動物形體進行全局分析,以檢測鼻尖(Nose position)、前部軀體中心(Forebody Center)、身體中心(Animal Center)和尾根(Tail Base position)四個特征點,並據此分析動物行為。

 

使用動物身體多個點模塊,軟件可以識別動物的鼻尖和尾根,當研究大鼠或小鼠的記憶時,動物鼻子與某個物體的接近或動物頭部朝向均屬於非常有用的參數。頭部朝向區域非常適用於新奇物體識別實驗,即研究動物對觀察區內部或者外部物體的興趣。新物體探索通常被定義為圍繞物體特定半徑內動物頭部的活動。“頭部朝向區域”變量分析大鼠或小鼠頭部朝向感興趣點的程度角度。

軟件還可以使用身體多個點檢測來更準確的分析進入迷宮或其他區域的前肢,並定義哪些身體點應該進入前肢,以便將其計入指標。後,該功能也是社會交互實驗研究的一個很好補充。

4.3 複雜精細行為檢測

係統可以全自動分析更多實驗動物的精細行為, 如爬行/靜止/原地微動,擺頭/甩頭,理毛修飾,轉圈,站立,靠邊行走,嗅探,伸長,身體彎曲等,並可以生成相應時間內的動物行為圖譜及時序圖;此模塊自動化可提高研究客觀性和有效性,因為其優點多於人眼觀察。該係統具有準確性、一致性和連續性。它將每次以相同方式對相同行為評分。特別是提高了長期觀察的有效性。人眼觀察會疲憊,對幾分鍾的視頻的行為評分可能需要數小時,而精細行為插件功能可以自動判斷,永遠不會讓人失望。

 

4.4 外部輸入輸出控製與觸發功能

將行為與生物信號(腦電圖、血壓、神經元活動、超聲波發聲)和實驗刺激(聲音、光、電擊等)整合,VisuTrack提供整合方案和模塊寫入等方式同步分析。利用智能的觸發選項功能,可以自定義Event和Action,實現自動開始分析、停止分析以及暫停分析、恢複分析等功能。

 圖為I/O box,輸入輸出控製器

舉個實驗案例,在使用光遺傳刺激進行行為研究時,實驗和硬件控製可以發揮很大的作用。可以根據動物行為或時間,利用實驗和硬件控製模塊來控製刺激。同時還可以記錄實驗期間出現的各種情況,因此,可輕鬆的分析光遺傳刺激行為後發生了什麽行為變化。

 

4.5 GLP實驗模塊

係統包含了GLP模塊(GLP Module),可以實現用戶權限、用戶策略分配,係統自帶管理員模式、審閱用戶模式以及實驗員模式,對應有不同的軟件使用權限,並可以導出符合GLP要求的操作日誌表以及審閱日誌表,同時可以開展動物行為“雙盲”實驗。

針對於學校構建動物行為實驗室平台,為方便高效管理,還可以額外允許根據實驗室要求,分配實驗員操作軟件的權限,為所有學員內置各種規範的實驗模版以及用戶自定義實驗模版。

4.6全麵實時功能

軟件具有全麵實時功能,可以實時顯示插件窗口,用以實時顯示動物的跟蹤狀態,判斷是否準確跟蹤;Event窗口,實時顯示動物跟蹤分析過程的精細行為事件;Result窗口,實時顯示指標測量結果;

4.7實驗複檢功能

軟件提供複驗功能,即對檢測的事件可以通過點擊來自動回/播放相應事件對應的視頻,便於校驗;可調整分析參數,對實時分析時錄下來的視頻/軌跡點進行重新分析以改進分析結果,而無需重做實驗重新記錄視頻/分析視頻;

4.8區域進入判斷標準

提供多種動物進入區域判斷標準:中心點進入、身體麵積進入以及體位點判斷進入,同時可以自定義相關判斷標準的閾值,動物處在不同的實驗容器中,芭乐app在线安装需要更換不同的判斷標準來提供實驗的可信度和準確性。

4.9同步分析不同類別實驗

同一套軟件可以在同一台電腦上同一時刻在線或離線分析不同的動物行為實驗,提高實驗效率的同時更增加了藥效評價的可靠性、實時性以及同步性,且分析結束後數據會自動按照實驗類別歸類,尤其適合應用於學校構建動物行為實驗公共平台和批量離線處理視頻。如圖,可以同時離線分析morris水迷宮、八臂迷宮、高架十字迷宮和曠場實驗視頻。

 

 

 

五、數據管理功能

5.1 實驗指標統計

VisuTrack軟件支持分段檢索數據、分組統計數據以及軌跡篩選功能,能夠讓用戶在不使用第三方軟件的情況下,也可以得到強大的統計處理功能,可以計算選中指標的方差和標準差,繪製並導出相應指標的直方圖。

 

5.2 曲線軌跡展示

VisuTrack軟件提供了多種形式的動物活動軌跡可視化展現方式:軌跡圖、軌跡矢量圖(支持多倍無損放大/縮小)、熱圖、3D熱圖、二維活動量圖以及三維活動量圖

  

六、豐富的插件功能(選配)

VisuTrack軟件提供了豐富的插件功能,方便為用戶擴展定製個性化的實驗和測試指標,目前,芭乐app在线安装已經定製了Morris水迷宮、曠場實驗、頭部探索行為以及交替行為等插件模塊,通過這些插件的啟用,用戶更加方便開展“不同尋常”的行為學實驗,並計算出“與眾不同”的行為學指標參數。

  • Morris水迷宮插件
  • 交替行為插件
  • 曠場實驗插件
  • 精細行為插件
  • 頭部探索行為插件
  • 巴恩斯迷宮插件
  • Lat迷宮插件
  • 強迫遊泳實驗插件
  • 懸尾實驗插件

6.1 Morris水迷宮插件

Morris水迷宮插件允許用戶額外的定義設置相關搜索策略區域參數(直線式搜索、趨向式搜索、邊緣式搜索),測試更加豐富的水迷宮實驗指標,同樣接受用戶定製各類深度的指標:轉向搜索、方向趨近、距離趨近等。

 

6.2 頭部探索行為插件

頭部探索行為插件在基礎模塊的三點識別的基礎上,引入了更加複雜的判斷機製來檢測動物頭部(鼻尖)是否有效接觸興趣物體,如頭部偏向、有效距離等。

 

6.3 曠場實驗插件

曠場實驗插件可以讓用戶進一步評價動物在曠場實驗箱裏的跨格行為,比如跨格次數和跨格等級、近壁距離、支撐性站立以及非支撐性站立等。

          

6.4 Y迷宮插件

Y迷宮插件可以擴展讓用戶在Y迷宮實驗中,檢測動物自發交替行為的相關參數,比如異臂單步循環次數(SAP),首尾同臂循環次數(AAR)以及同臂單循環次數(SAR)。

 

七、測試指標

芭乐app最新版本下载官网為用戶提供了非常豐富的動物行為測試參數,通過這些參數可以幫助用戶分析各類動物行為信息。所有的測試指標到每一個用戶定義的分析區域。

常規指標:活動路程、逗留時間、運動速度

實驗指標:各區域潛伏期(*進入時間)、進入次數、進入深度、路程比例

特色指標:休息(靜止)時間、掙紮時間、Freezing時間、Freezing次數

探索指標:頭部接觸次數、接觸時間、接觸潛伏期、接近時間、大距離

精細行為指標:飲水次數、飲食次數、甩頭次數、修飾行為、卷縮行為、嗅探行為、伸長、僵直等

插件指標:轉向搜索、方向趨近、接近度、交替行為、跨格次數、跨格等級、支撐站立、搜索策略、自定義區域周邊活動情況、嗅聞半徑等

 

八、係統組成

VisuTrack完整的係統方案包涵VisuTrack軟件(按模塊選配)、采集模塊、實驗儀器

其中,VisuTrack軟件支持安裝Win Xp和Win7係統、Win10係統,采集模塊包括USB采集卡、攝像機,實驗儀器需要根據用戶的課題方向選配,如Morris水迷宮、高架十字迷宮、曠場實驗等。

   VisuTrack動物行為視頻分析軟件

相機建議黑白槍式攝像機,700線清晰度

采集卡建議選擇USB采集卡,這樣軟件可以裝在筆記本裏

九、軟件擴展升級

上海芭乐app最新版下载黄已經為“Super”係列和“Track”係列動物行為分析軟件申請了數項軟件著作權,擁有核心識別算法技術和後續軟件持續升級維護的能力。

VisuTrack軟件 3 年內免費升級,不升級不會影響用戶的正常使用。

芭乐app在线观看通常選擇學校暑假前夕(7月)和寒假前夕(12月)左右聯係用戶升級。

 

 

十、典型客戶

ü 中科院納米研究所

ü 軍事醫學科學院

ü 中科院生物物理研究所

ü 中科院心理研究所

ü 中科院藥物研究所

ü 北京大學生命科學院

ü 北京大學醫學部  藥物依賴所

ü 上海交通大學

ü 中國農業大學

ü 山東中醫藥大學

ü 昭衍(蘇州)新藥研究中心有限公司

ü 上海綠穀製藥有限公司

ü 江漢大學

ü 蘇州大學

ü 南京大學

用戶名單未詳盡列出,排名不分先後。

十一、軟件擴展

VisuTrack軟件是上海芭乐app最新版下载黄信息科技有限公司開發的新一代動物行為分析係統,可以適用於幾乎所有的動物行為實驗測試,芭乐app最新版本下载官网秉承“一切為了實驗”的宗旨,將會一如既往的將更多的“黑科技”引入到行為分析軟件當中。VisuTrack的插件模塊(選配)將持續更新,芭乐app在线安装也非常希望能夠吸納更多客戶的實驗需求。目前,“Track”係列軟件正在開拓FishTrack斑馬魚行為分析軟件CageTrack齧齒動物日常行為監測軟件

 

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